马龙古称铜濑邑，西汉元封二年（公元前109年）置铜濑县，属益州郡。蜀汉、西晋、宋、齐沿称铜濑县，隶属建宁郡。唐初更名同起县，归南宁州（郎州）。南诏时为爨部曲轭地。宋大理国时为纳苟部所居。元初置千户所，至元十三年（1276年）始设马龙州领通泉县属曲靖路。明、清属曲靖府。民国18年（1929年）称马龙县。1950年3月，设马龙县，其间于1958年10月并入曲靖县，1961年7月复置至今。